Big data elemzéssel a fertőző betegségek ellen
A pályázatot Az Újonnan felbukkanó fertőző betegségek obszervatóriuma (Versatile Emerging infectious disease Observatory: VEO) címmel közösen nyújtotta be húsz, nemzetközi hírű kutatócsoport. A VEO adattudósok, technológiai szakértők, egészségügyi és akadémiai járványügyi szakemberek, társadalomtudósok és "citizen scientist"-ek munkáját ötvözi.
A projektben a big data elemzést hívják segítségül a klímaváltozás és egyéb faktorok által előidézett fertőző betegségek általi fenyegetettség korai felderítésére. A szakemberek célja egy sokoldalú, előrejelzést és nyomon követést biztosító virtuális figyelőrendszer létrehozása, mely bizonyítékok alapján korai előrejelzésre és kockázatelemzésre alkalmas az újonnan felbukkanó fertőző betegségekkel, valamint a gyógyszer rezisztenciával kapcsolatban –
A COVID-19 terjedésének időbeli lefutása Papp Krisztián (ELTE) grafikonján
(március 13-i felvétel)
A VEO adatplatform támogatja a hagyományos és újfajta biológiai adatok bányászatát, megosztását, bemutatását és elemzését. Lehetővé teszi majd az adatintenzív interdiszciplináris együttműködést akár földrajzilag távol levő nemzetközi kutatócsoportok között, bevonva a kutatás iránt érdeklődő polgárokat is. Új megoldásokat is fejlesztenek, hogy nagy adattartalmú, például a genomika által szolgáltatott információk integrálhatók legyenek a VEO rendszerébe, segítve ezzel a kockázatértékelést.
A VEO rendszer bemutat öt, egymást kiegészítő felhasználási forgatókönyvet, melyek tükrözik a betegségek megjelenésének főbb útvonalait,
bizonyítva a megoldás hatékonyságát, figyelembe véve az etikai, jogi és társadalmi következményeket is. Az egyik ígéretes megközelítés lehet a környezeti minták folyamatos monitorozása, mellyel még járványok széleskörű elterjedése előtt kimutathatók lennének a veszélyes kórokozók.
A VEO projekten belül Csabai István által irányított munkacsomag célja egy innovatív felhő alapú kollaboratív platform fejlesztése, adatbázis technikák, gépi tanulási megoldások, változatos adatelemző és modellező eszközök integrálása.
Forrás: ELTE TTK
Borítókép: Pixabay